BYKdb

Dataset for cluster tadcd of phylum candidatus-rokubacteria

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                  :      . :    
--ms----p-rd-r-lp-g---------------------ra------yp---eee--hfwdywrvlrr--rrwtvlavf
mv--dlwr-e--t-s--p-dpgpelvqsrapttlapvept--ehvayg--ygva--ts-----lstiakiahvrliisft
 tinavvdsrvppppvssateyvqiapgpvsrli  paiatlrpmsqvrtvpa-hrgvswarl-dmvsc  nk rlvtci
  eettttftpea mrravrdtlg  elhs mi   l tv  dle f hagvltkgfpd r is-l n   f    agsc
    sqqs lh s apal ea h     ep d    a  q         g  gddda     f qa l         cla
    nppe de l      a        d  a                       a        h               
    gfn  aa                                                                     
    edl                                                                         

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       .           : . . : .                   :                    :: *  :   .:
lvtva--avtiatfttrPvYtasAtlrie---------rprivkfeevvkdadsqqdyyq----tqykllqSrtlanrvi
vlvttlpvtavwsamqkkmfrgtvrvlvdvagrrgpkeqytvlplqqiei-rpdmtnffedplls-feiir ysviqaav
sgalv   amylvyfae i l v kiwl-       sdprkrdtpgvmrdpe---d----    -wvr  t gp ldq  
f gii   gvlyav vp e e q v ff        nre hpirgdmll wm ns-es a      ld  k  v  g   
a   l    ggv r lg   a   s           d d  a qa     g  ar ar         a  e     e   
          f    i                      g           e   a                         
                                                                                
                                                                                

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                                                                
--gllqldq------------------------------hpefaqa-------er-ea--r-----lvrwipvppppape
rddgvpratrstrkfspsltgrvavqyrsgaysfsvtrsrqglvgpprerglv--t--wv-evrrw--------------
  espfmsrvlladalalelfg  dapdpa hr qlgfggedysrltmpkswnagraltgsvmgqqvisyavqqrtv kq
   r   lpt                             edl qaemhrgygltsltsyrkradllsfqfs lhg s  g
   n   e s                              a  evde qdieqqqgnirl q   gg i   a   a   
                                            l   gpa ig a dgf a   e              
                                                d   d     fd     d              
                                                                                

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                    :          : :      *       *  .:       .          : :   :. 
--edl---s--plasaflgrvtvepvrssrlVkvsfdsgdPdlAarvaNtvadafvaqqlDqkvegtryatqfLakqlke
gt---vlt-lrdptktvseglsirvipntn-ldirvedhy vfitdlv aivngyirhvsslrlrastnsyeyitneven
avvqvtvet  saieylqah kftmrlggei r ayvaph rr qeap rl evlmtvsa rmrkqlktrrki etl dv
ralefmdae  av trqisk ra  l radf y elsgyn ev mai   y qr rqrer niidka sls   gd  qq
efd  l q      dl  k  d   d d    e  ar  f a        t    q a m aaq e  l      a  nh
     a                                 a                            e           
                                                                                
                                                                                

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    *  :   *                                                         :     .    
trdkLreaEmaLtrf-----------------------------lnghqilfvt-adr-gqrqdlitqqls---llseay
mkgs nrsrgk nkyreetitlpserptvgaavtgppgsapvagkeendlillpg---g-eqanaaaskmtrqqdmhdsl
aqtr gq  eq gnv                             qratn--g-- gsknsapseilslgfa   qfqarr
sdsn ed  th se                              atsrgpy-ss vlvtr grapvlge f   evengf
n el   q  qa                               kra-gv in sasmp an  pga  e     am w
       d  a                                g  r   ag    l      e              
                                             a       a    a                     
                                                                                

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                                   .  :     .                     * :     .     
lkartdriakesllaqa-----sgqdvnslpavlqspllaqlkqqlaaleteyrkll--qtfkpdyPrmqqlaekiaeir
vdvqgrklelgaqmttvkgsglrtrgpdtaaleaknraisgrradettaqs-lnn-asrkvytdkh avvraraqlddt-
teiaaeaslrkvstrllgdkdanegtlgvvgvqqvtemvvkaseegfgqrad--rfs  yrrqtsl plratvqetktgq
ere ss miadrr srk     avppasq  smge sr le qtk  qy -arq- g  sk h q  l nl qss ea-e
a   rl e       pg      idanpa  q  a  e    lk    k m  ks -  ei   h  h l  kg    s 
    l  a                   l   g                  g  eg r   a   g    k        n 
                           f                         d                        l 
                                                                              a 

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                            .         .            :                   *.  .    
rql--------------------rteigravaalqadyqaavrteqemeqaleryrklargladrmaeynlLrrevdtsR
ar-tagpqglpervaapqfgaaekaaldkvlqsvegqvkiqkar-aallasfaqqsgetqrisrkevqfav qqsatvge
h-t                    qv-ha tfrgqrsgregsa-slriisvrivktktslsdgpestltesr ker esq 
-m                     -- -- qied lqefss--t- -grks  tdl rqwgn landikv k   d  na 
d                      ip sr la   k a   ll   k  ir  dah qm a  gqqa           l  
                                         i   e   g    d lh      e               
                                         e   d          ag                      
                                                                                

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
.:   *      . :        : : : * :.  *        : :. : .:  .   * . :     :    ::    
dlydsLlgrlretqissalntsnirvvdrAevPtrPsrprraqnlllgclvGlvgGvglAflfEyldtsikdpkeVesll
emlaf ikqyqtaglaaeslvntvsiaea tissf ikvkkllvivmalvasillalvi lvldfaednvqntddiaqvt
nvvtt sak gkvrvqevifdrqlyll s al rt ysnnaprqfav mig f img ifi rfkstmryaeta-m
k ase rve d      qgt gg e i p v  qm vgitlmtl  i f     sav g a   gqr etrv  sre 
    a qq           e  d     l    nk a  p se             a        pp aqe     a 
       e                    h    ih    g                                        
                                 gg                                             
                                                                              

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  . :* :.                                       *: . :   :           : ::*  . :*
rvplLGlvPsrqal-rsarrrra---g--dd-apfalvehsgmdsvfvEafrnlrtsLlysspdhpPrtilvTSptpedG
gataf tltvlr--sprrlkda-laa-ptp-k-rhr--atdqastras slnligvairsdtngslvkrltma lhsqe 
 lsv  vi ywhgvg--l-appevvs vr-slt---fl---e-gdmva  c gvclt vnmyrarg lvvm agag  
 m t  w  tva seqg-q- krreq  kqp r ms isvadtaalpi    s   n s eagepd il    q    
   i  m  hid f vppkg egpnk   nr l    adqf-p- d              aq  ea         y    
      a         mga  d h h   ae g     c  tlp a                  a               
                 d     f g      e        adn                                    
                         d                                                      

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*: :  **.  :   .    :::* *:*.  :   :     ..:             : .                ..  
KtslvtNLaitlaqlGt-rvLlvDaDmRrptLhrvlgvrqapglstfltgqapladvvvptaipnLslipsGrvplnpae
 stiaa  svvfsraasgetivi t l hgsvdeifslptpsdigeyarrgtevgeairasgvrgqlvlgvttitgsala
  fvss  gys v-y rvpi m  g i   n nnf riart   tda ishvsreailqtisygf fsaaa lrrvsv
     l   la  e  as l          v   r naekr   v v a eld tq  k  rd s di  g  dgs  
              kq            m   p e  vq         d a np     p  h  f  c   ar  
                h             a   l     k                    k     a       a    
                g                                                               
                                                                                

       810       820       830       840       850       860       870       880
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*: :  :   .         ::.*  *:    * : :.       :*:* *   .         :  :   ::* : :  
LlaSarfsqaldaLgqrfdyivfDtgPlfgvsDamiLApqvegvvlVlRhGrasrdaaqravrsLlrvrarlLGvvlndv
 ikatylraqvttaaeeyalvlv sp itlia slavggltgnilv v q hgtqwrlrkmigqvdsipvpvv fiydgy
 mg svmkrlies rgta v il ia vgagv g v  amadhlim   t ytq rmsvaklev talglk   a   
  t qnivemf l evs  h       ml    p    t l ata    l vsh el e  kdn rk           
  s da pd   g ksh                n    s          a   d  d a   am              
       a       pg                     k                        i              
               a                                                                
                                                                                

       890       900       910       920       930         
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....
        *  *                                               
dvrgtg-yYgYY--gyY-----------Gygakrttaarag-r--g-------------
tpgddrrh ss ms--altneppfrplg-aprssgsrgg--n-tv-sgspvaddsrras
essaqkys   dsn  s          negrnshg-arnvqsgtrhetirrsekvg 
slhseygg    d              -svveeevv-kehsnqqaww          
rieen  a                     kqsnka se erg kh psv          
pd  a                         d gd  n  s f  a  rt          
 a                              ea             la          
                                a                          
© 1998-2019